Showing metabocard for PIP(18:0/16:2(9Z,12Z)) (HMDB0009948)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 5.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Expected but not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2008-09-12 02:02:31 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2022-11-30 19:03:44 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | HMDB0009948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary Accession Numbers |
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Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | PIP(18:0/16:2(9Z,12Z)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | PIP(18:0/16:2(9Z,12Z)) is a phosphatidylinositol phosphate. Phosphatidylinositol phosphates are acidic (anionic) phospholipids that consist of a phosphatidic acid backbone, linked via the phosphate group to a phosphorylated inositol (hexahydroxycyclohexane). Phosphatidylinositol phosphates are generated from phosphatidylinositols, which are phosphorylated by a number of different kinases that place the phosphate moiety on positions 4 and 5 of the inositol ring, although position 3 can also be phosphorylated. Phosphatidylinositols phosphates can have many different combinations of fatty acids of varying lengths and saturation attached at the C-1 and C-2 positions. Fatty acids containing 18 and 20 carbons are the most common. PIP(18:0/16:2(9Z,12Z)), in particular, consists of one chain of stearic acid at the C-1 position and one chain of (9Z,12Z-hexadecadienoate) at the C-2 position. The stearic acid moiety is derived from animal fats, coco butter and sesame oil, while the (9Z,12Z-hexadecadienoate) moiety is derived from fish oils. The most important phosphatidylinositol phosphate in both quantitative and biological terms is phosphatidylinositol 4-phosphate. Phosphatidylinositol and the phosphatidylinositol phosphates are the main source of diacylglycerols that serve as signaling molecules, via the action of phospholipase C enzymes. Phosphatidylinositols phosphates are usually present at low levels only in tissues, typically at about 1 to 3% of the concentration of phosphatidylinositol. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C43H80O16P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Weight | 915.0332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Molecular Weight | 914.492159536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | {[(1R,3S)-3-({[(2R)-2-[(9Z,12Z)-hexadeca-9,12-dienoyloxy]-3-(octadecanoyloxy)propoxy](hydroxy)phosphoryl}oxy)-2,4,5,6-tetrahydroxycyclohexyl]oxy}phosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | [(1R,3S)-3-{[(2R)-2-[(9Z,12Z)-hexadeca-9,12-dienoyloxy]-3-(octadecanoyloxy)propoxy(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2,4,5,6-tetrahydroxycyclohexyl]oxyphosphonic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@]([H])(COP(O)(=O)O[C@H]1C(O)C(O)C(O)[C@@H](OP(=O)(O)O)C1O)OC(=O)CCCCCCC\C=C/C\C=C/CCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C43H80O16P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-20-21-23-25-27-29-31-36(44)55-33-35(57-37(45)32-30-28-26-24-22-19-16-14-12-10-8-6-4-2)34-56-61(53,54)59-43-40(48)38(46)39(47)42(41(43)49)58-60(50,51)52/h8,10,14,16,35,38-43,46-49H,3-7,9,11-13,15,17-34H2,1-2H3,(H,53,54)(H2,50,51,52)/b10-8-,16-14-/t35-,38?,39?,40?,41?,42-,43+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | RRZYOTAEGFUXJE-ZWOKQJHSSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Belongs to the class of organic compounds known as glycerophosphoinositol phosphates. These are lipids containing a common glycerophosphate skeleton linked to at least one fatty acyl chain and an inositol-5-phosphate moiety. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Lipids and lipid-like molecules | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Glycerophospholipids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Glycerophosphoinositol phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Glycerophosphoinositol phosphates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aliphatic homomonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physiological effect | Health effect
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Disposition | Biological location
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Process | Naturally occurring process
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Role | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Molecular Properties |
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Experimental Chromatographic Properties | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted Molecular Properties |
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Predicted Chromatographic Properties | Predicted Collision Cross Sections
Predicted Kovats Retention IndicesNot Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MS/MS Spectra
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Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations |
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Pathways |
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Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated Disorders and Diseases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease References | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Associated OMIM IDs | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemspider ID | 24767829 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound | 53480143 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMH ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MarkerDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Good Scents ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Material Safety Data Sheet (MSDS) | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References | Not Available |
Only showing the first 10 proteins. There are 80 proteins in total.
Enzymes
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB1
- Uniprot ID:
- Q9NQ66
- Molecular weight:
- 138565.805
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. This form has a role in retina signal transduction.
- Gene Name:
- PLCB4
- Uniprot ID:
- Q15147
- Molecular weight:
- 136105.065
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB2
- Uniprot ID:
- Q00722
- Molecular weight:
- 134023.21
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes.
- Gene Name:
- PLCB3
- Uniprot ID:
- Q01970
- Molecular weight:
- 138797.725
- General function:
- Involved in phosphoinositide phospholipase C activity
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. It is a crucial enzyme in transmembrane signaling.
- Gene Name:
- PLCG2
- Uniprot ID:
- P16885
- Molecular weight:
- 147868.67
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- Mediates the production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3). Plays an important role in the regulation of intracellular signaling cascades. Becomes activated in response to ligand-mediated activation of receptor-type tyrosine kinases, such as PDGFRA, PDGFRB, FGFR1, FGFR2, FGFR3 and FGFR4. Plays a role in actin reorganization and cell migration.
- Gene Name:
- PLCG1
- Uniprot ID:
- P19174
- Molecular weight:
- 148658.92
- General function:
- Involved in calcium ion binding
- Specific function:
- The production of the second messenger molecules diacylglycerol (DAG) and inositol 1,4,5-trisphosphate (IP3) is mediated by activated phosphatidylinositol-specific phospholipase C enzymes. Essential for trophoblast and placental development.
- Gene Name:
- PLCD1
- Uniprot ID:
- P51178
- Molecular weight:
- 88134.23
- General function:
- Involved in N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol de
- Specific function:
- Involved in the second step of GPI biosynthesis. De-N-acetylation of N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol.
- Gene Name:
- PIGL
- Uniprot ID:
- Q9Y2B2
- Molecular weight:
- 28530.965
- General function:
- Involved in phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase activity
- Specific function:
- Part of the complex catalyzing the transfer of N-acetylglucosamine from UDP-N-acetylglucosamine to phosphatidylinositol, the first step of GPI biosynthesis.
- Gene Name:
- PIGQ
- Uniprot ID:
- Q9BRB3
- Molecular weight:
- 65343.25
- General function:
- Involved in biosynthetic process
- Specific function:
- Necessary for the synthesis of N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol, the very early intermediate in GPI-anchor biosynthesis.
- Gene Name:
- PIGA
- Uniprot ID:
- P37287
- Molecular weight:
- 54126.065
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